ساختار سازمانی شرکت آتی شهر هوشمند ایرانیان بر پایه الگوهای نوین مدیریتی و با هدف ایجاد هم‌افزایی میان بخش‌های مختلف طراحی شده است. این ساختار از دو سطح اصلی راهبردی (شامل هیئت‌مدیره جهت تبیین چشم‌اندازها) و عملیاتی (شامل مدیرعامل و معاونت‌های تخصصی جهت اجرای پروژه‌ها) تشکیل شده است. تقسیم‌بندی دقیق مسئولیت‌ها در لایه‌های مختلف مدیریتی، توسعه کسب‌وکار و امور اجرایی، این امکان را فراهم آورده تا نظارت مستمر بر کیفیت خدمات حفظ شده و مسیر حرکت شرکت به سوی تحقق اهداف شهر هوشمند هموارتر گردد.